Ngày 13 tháng 12 năm 2001, xã Chí Thảo thuộc huyện Quảng Uyên vừa tái lập từ huyện Quảng Hòa.

Ngày 1 tháng 10 năm 2010, điều chỉnh 391,7 ha diện tích tự nhiên và 507 người của xã Chí Thảo vào thị trấn Quảng Uyên. Xã Chí Thảo còn lại 2.749,61 ha diện tích tự nhiên và 3.066 người.[3]

Đến năm 2019, xã Chí Thảo được chia thành 16 xóm: Kéo Bắc - Pác Nà, Rai Khang, Khưa Lay, Lũng Miêng, Cốc Coóc, Nà Rạc, Bó Cái, Lũng Nu, Lũng Lù, An Mạ, Lúng Ngưu, Lúng Lỳ, Canh Man, Lúng Ngườm, Giao Thượng, Giao Hạ.

Ngày 9 tháng 9 năm 2019, sáp nhập hai xóm Kéo Bắc - Pác Nà và Rai Khang thành xóm Hưng Yên, sáp nhập hai xóm Khưa Lay và Lũng Miêng thành xóm Xuân Lợi, sáp nhập hai xóm Cốc Coóc và Nà Rạc thành xóm Yên Lạc, sáp nhập ba xóm Bó Cái, Lũng Nu, Lũng Lù thành xóm Minh Hòa, sáp nhập ba xóm An Mạ, Lúng Ngưu, Lúng Lỳ thành xóm An Lạc, sáp nhập hai xóm Canh Man và Lúng Ngườm thành xóm Tiền Long, sáp nhập hai xóm Giao Thượng và Giao Hạ thành xóm Đồng Giao.[4]

Ngày 11 tháng 2 năm 2020, huyện Quảng Uyên giải thể để tái lập huyện Quảng Hòa. Xã Chí Thảo thuộc huyện Quảng Hòa như hiện nay.[5]